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be3beee2
Commit
be3beee2
authored
Aug 07, 2019
by
Piotr Gawron
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unused css removed
parent
2c5638e7
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1
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Inline
Side-by-side
web/src/main/webapp/resources/css/pileup.css
deleted
100644 → 0
View file @
2c5638e7
/**
* This is the default stylesheet for pileup.js.
* In general, it attempts to look like IGV.
* You are encouraged to override anything you like.
*/
.pileup-root
{
display
:
flex
;
flex-direction
:
column
;
height
:
100%
;
}
.pileup-root
>
.track
{
display
:
flex
;
flex-direction
:
row
;
}
.pileup-root
text
,
.track-label
{
font-family
:
'Helvetica Neue'
,
Helvetica
,
Arial
,
sans-serif
;
}
.track-label
{
flex
:
0
0
100px
;
/* fixed-width track labels */
text-align
:
right
;
font-size
:
0.9em
;
position
:
relative
;
/* make this an offset parent for positioning the label. */
}
.track-label
>
span
{
padding-right
:
5px
;
}
/* bottom-justify these track labels */
.track.reference
.track-label
>
span
,
.track.variants
.track-label
>
span
{
position
:
absolute
;
bottom
:
0
;
right
:
0
;
}
.track-content
{
flex
:
1
;
/* stretch to fill remaining space */
overflow-y
:
auto
;
overflow-x
:
hidden
;
position
:
relative
;
}
.track-content
>
div
{
position
:
absolute
;
/* Gets the child of the flex-item to fill height 100% */
}
.track-content
canvas
{
display
:
block
;
}
/* controls */
.pileup-root
>
.controls
{
flex
:
0
0
30px
;
/* fixed height */
}
.pileup-root
>
.controls
>
.track-content
{
overflow
:
visible
;
}
.pileup-root
>
.controls
form
.controls
{
margin-bottom
:
0
;
/* overrides browser default */
}
.pileup-root
>
.controls
.zoom-controls
{
display
:
inline-block
;
}
.pileup-root
>
.controls
.btn-zoom-out
:before
{
content
:
'-'
;
}
.pileup-root
>
.controls
.btn-zoom-in
:before
{
content
:
'+'
;
}
.pileup-root
>
.controls
input
,
.pileup-root
>
.controls
button
,
.pileup-root
>
.controls
select
,
.pileup-root
>
.controls
option
{
font-size
:
0.9em
;
}
.gear
{
margin-left
:
0.5em
;
font-size
:
2em
;
color
:
#666
;
}
.gear
:hover
{
color
:
black
;
}
.menu-container
{
z-index
:
1
;
width
:
250px
;
/* not really 250px, but clears parent constraint */
}
.menu
{
border
:
1px
solid
black
;
border-radius
:
2px
;
display
:
table
;
background
:
white
;
font-family
:
'Helvetica Neue'
,
Helvetica
,
Arial
,
sans-serif
;
text-align
:
left
;
}
.menu-header
{
font-weight
:
bold
;
border-bottom
:
1px
solid
#777
;
padding
:
2px
4px
;
}
.menu-item
{
padding
:
4px
;
}
.menu-separator
{
border-top
:
1px
solid
#777
;
height
:
0px
;
}
.menu-item
:hover
{
background
:
lightblue
;
}
.check
{
display
:
inline-block
;
width
:
1em
;
}
.check.checked
:before
{
content
:
'✓'
;
}
/* reference track */
.pileup-root
>
.reference
{
flex
:
0
0
20px
;
/* fixed height */
}
.background
{
fill
:
white
;
}
.basepair.A
{
fill
:
#188712
;
}
.basepair.G
{
fill
:
#C45C16
;
}
.basepair.C
{
fill
:
#0600F9
;
}
.basepair.T
{
fill
:
#F70016
;
}
.basepair.U
{
fill
:
#F70016
;
}
.basepair
text
,
text
.basepair
{
text-anchor
:
middle
;
}
.loose
text
{
font-size
:
24
;
}
.tight
text
{
font-size
:
12
;
font-weight
:
bold
;
}
/* gene track */
.pileup-root
>
.genes
{
flex
:
0
0
50px
;
}
.gene
{
stroke-width
:
1
;
stroke
:
blue
;
}
.gene
text
{
font-size
:
16px
;
text-anchor
:
middle
;
stroke
:
black
;
alignment-baseline
:
hanging
;
}
#sense
,
#antisense
.main
{
stroke
:
blue
;
fill
:
none
;
stroke-width
:
1
;
}
#antisense
.offset
,
#sense
.offset
{
stroke
:
white
;
fill
:
none
;
stroke-width
:
1
;
}
.exon
{
fill
:
blue
;
stroke
:
none
;
}
/* pileup track */
.pileup-root
>
.pileup
{
flex
:
1
;
/* stretch to fill remaining space */
}
.pileup
.alignment
.match
{
fill
:
#c8c8c8
;
/* matches IGV */
}
.pileup
text
.basepair
{
alignment-baseline
:
hanging
;
font-size
:
12
;
font-weight
:
bold
;
}
.pileup
.insert
{
stroke
:
rgb
(
97
,
0
,
216
);
/* matches IGV */
stroke-width
:
2
;
}
.pileup
.delete
{
stroke
:
black
;
stroke-width
:
2
;
}
.pileup
.network-status
{
height
:
100%
;
width
:
100%
;
display
:
flex
;
align-items
:
center
;
justify-content
:
center
;
}
.pileup
.network-status-message
{
padding
:
4px
8px
;
width
:
auto
;
background
:
#eee
;
border-radius
:
3px
;
border
:
1px
solid
#ccc
;
font-size
:
small
;
}
.pileup
.mate-connector
{
stroke
:
#c8c8c8
;
/* matches IGV */
}
/* variants */
.pileup-root
>
.variants
{
flex
:
0
0
25px
;
/* fixed height */
}
.variants
rect
{
fill
:
#ddd
;
stroke
:
blue
;
}
/* coverage track */
.pileup-root
>
.coverage
{
flex
:
0
0
50px
;
/* fixed height */
}
.coverage
rect
.bin
{
stroke-width
:
0.1
;
stroke
:
white
;
fill
:
#a0a0a0
;
}
.coverage
.y-axis
{
stroke
:
black
;
stroke-width
:
1
;
}
.coverage
.y-axis
g
.tick
text
{
color
:
black
;
font-size
:
x-small
;
stroke
:
whitesmoke
;
stroke-width
:
2
;
paint-order
:
stroke
;
}
.coverage
.y-axis
path
{
stroke-width
:
0
;
}
.coverage
rect
.y-axis-background
{
fill
:
white
;
opacity
:
0.5
;
}
/* location track */
.pileup-root
>
.location
{
flex
:
0
0
20px
;
/* fixed height */
}
.location
.location-hline
,
.location
.location-vline-left
,
.location
.location-vline-right
{
stroke
:
gray
;
stroke-width
:
1.5
;
}
.location
.location-label
{
color
:
black
;
font-size
:
smaller
;
text-anchor
:
start
;
dominant-baseline
:
central
;
}
/* scale track */
.pileup-root
>
.scale
{
flex
:
0
0
20px
;
/* fixed height */
}
.scale
.scale-lline
,
.scale
.scale-rline
{
stroke
:
gray
;
stroke-width
:
1.5
;
}
.scale
.scale-label
{
color
:
black
;
font-weight
:
bold
;
font-size
:
smaller
;
dominant-baseline
:
central
;
text-anchor
:
middle
;
}
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